Для осуществления своих задач и функций Совет имеет право:
1. Запрашивать и получать от государств - участников Соглашения информацию, не являющуюся закрытой, необходимую для выполнения своих функций, а также информацию о выполнении решений Совета.
2. Вносить в установленном порядке на рассмотрение Совета глав государств, Совета глав правительств и других органов СНГ проекты документов, подготовленные Советом.
3. Создавать постоянные или временные рабочие группы для решения конкретных задач, принимать регламент их работы, назначать руководителей и контролировать деятельность таких групп.
4. Осуществлять действия, направленные на развитие и совершенствование экологической экспертизы, в том числе планов и программ, а также проведение оценки воздействия на окружающую среду планируемой деятельности в трансграничном контексте.
5. Вырабатывать согласованные подходы государств - участников СНГ в области охраны окружающей среды на международных форумах и при реализации международных инициатив по вопросам, представляющим взаимный интерес.
6. Разрабатывать и утверждать регламент своей работы, а также вносить в него изменения.