5.1. Заседания Совета проводятся не реже одного раза в год. По мере необходимости могут созываться внеочередные заседания.
Внеочередное заседание Совета созывается председателем Совета по его инициативе или по предложению не менее трех членов Совета.
5.2. Решения Совета являются правомочными, если на заседании представлены не менее двух третей членов Совета.
5.3. Место, время и повестка дня заседания определяются по предварительной договоренности членов Совета.
5.4. Совет ежегодно предоставляет в Исполнительный комитет СНГ информацию о своей деятельности.
5.5. По решению Совета в его заседаниях в качестве наблюдателей могут участвовать представители заинтересованных ведомств государств, не являющихся участниками Соглашения, и организаций, в том числе международных.
5.6. Решения Совета принимаются простым большинством голосов его членов, присутствующих на заседании, если иное не определено Советом. При принятии решений каждое государство имеет один голос.
Любой член Совета может заявить о своей незаинтересованности в том или ином вопросе, что не должно рассматриваться как препятствие для принятия решения.
Члены Совета, не согласные с решением, могут выразить особое мнение, которое вносится в протокол заседания.
5.7. Решения Совета подписываются председателем Совета.
5.8. Решения Совета, непосредственно затрагивающие интересы какого-либо государства - участника Соглашения, не могут приниматься в отсутствие его представителя.
5.9. Заседания Совета проводятся в соответствии с Регламентом, утвержденным Советом.
5.10. Материалы к очередному заседанию Совета направляются участникам заседания не позднее чем за 30 дней до даты его проведения.
5.11. Организационно-техническое и информационное обеспечение деятельности Совета осуществляется его секретариатом, функции которого возлагаются на федеральное государственное бюджетное учреждение "Всероссийский центр карантина растений".
Положение о секретариате утверждается Советом.
5.12. Совет избирает председателя на первом заседании.
5.13. Председатель организует работу Совета, руководит его заседаниями, обеспечивает соблюдение Регламента.