1. Руководство деятельностью Фонда осуществляется правлением и исполнительным директором.
2. В состав правления входят:
1) три депутата Законодательного Собрания Забайкальского края;
2) четыре представителя исполнительных органов государственной власти Забайкальского края, в том числе осуществляющих управление в сфере здравоохранения, финансов и социальной защиты населения;
3) один представитель Главного управления Центрального банка Российской Федерации по Забайкальскому краю;
4) один представитель страховщиков;
5) один представитель профессиональной медицинской ассоциации Забайкальского края;
6) два представителя страхователей;
7) два представителя профсоюзов;
8) исполнительный директор Фонда.
3. Состав правления Фонда утверждается Законодательным Собранием Забайкальского края.
4. Правление возглавляет председатель. Председатель правления имеет одного заместителя. Председатель правления и его заместитель избираются правлением Фонда.
5. Исполнительный директор Фонда назначается на должность и освобождается от должности высшим исполнительным органом государственной власти Забайкальского края по согласованию с правлением Фонда.