Фонд выполняет следующие функции:
1) аккумулирует финансовые средства на обязательное медицинское страхование граждан на территории Забайкальского края;
2) осуществляет финансирование обязательного медицинского страхования, проводимого страховыми медицинскими организациями, имеющими соответствующие лицензии (далее - страховщики), заключившими договоры обязательного медицинского страхования по дифференцированным подушевым нормативам;
3) осуществляет финансово-кредитную деятельность по обеспечению системы обязательного медицинского страхования, обеспечивает развитие приоритетных направлений здравоохранения;
4) осуществляет контроль за полнотой и своевременностью уплаты страховых взносов на обязательное медицинское страхование неработающего населения;
5) выравнивает финансовые ресурсы городов и районов Забайкальского края на проведение обязательного медицинского страхования;
6) накапливает финансовые резервы для обеспечения устойчивости системы обязательного медицинского страхования;
7) предоставляет субвенции страховщикам при обоснованном недостатке у них финансовых средств для оплаты медицинской помощи, предоставленной застрахованным в рамках Территориальной программы государственных гарантий оказания гражданам Российской Федерации бесплатной медицинской помощи;
8) разрабатывает правила обязательного медицинского страхования граждан на территории Забайкальского края;
9) осуществляет контроль за рациональным использованием финансовых средств, направляемых на обязательное медицинское страхование граждан;
10) осуществляет регистрацию страхователей при обязательном медицинском страховании в соответствии с федеральным законом;
11) разрабатывает совместно с исполнительным органом государственной власти Забайкальского края, осуществляющим управление в сфере здравоохранения, профессиональными медицинскими ассоциациями Территориальную программу государственных гарантий оказания гражданам Российской Федерации бесплатной медицинской помощи и вносит предложения о финансовых ресурсах, необходимых для ее осуществления;
12) вносит предложения о страховом тарифе взносов на обязательное медицинское страхование неработающего населения;
13) в установленном порядке участвует в определении тарифов на медицинские и иные услуги по обязательному медицинскому страхованию совместно с исполнительными органами государственной власти Забайкальского края, страховщиками, профессиональными медицинскими ассоциациями (при их отсутствии интересы медицинских учреждений могут представлять профсоюзы медицинских работников);
14) производит оплату медицинских услуг, оказанных гражданам, прибывшим из других субъектов Российской Федерации;
15) финансирует мероприятия по здравоохранению в рамках региональных целевых программ, утвержденных в установленном порядке, для медицинских учреждений, функционирующих в системе обязательного медицинского страхования;
16) формирует нормированный страховой запас, предназначенный для обеспечения финансовой устойчивости системы обязательного медицинского страхования на территории Забайкальского края;
17) формирует средства, предназначенные для обеспечения управленческих функций Фонда по нормативу, устанавливаемому исполнительным директором по согласованию с правлением Фонда в процентах к размеру всех поступивших средств без учета остатка финансовых средств на начало года;
18) осуществляет взаимодействие с Федеральным фондом обязательного медицинского страхования и территориальными фондами обязательного медицинского страхования других субъектов Российской Федерации;
19) представляет Федеральному фонду обязательного медицинского страхования информацию о финансовых ресурсах системы обязательного медицинского страхования Забайкальского края и другую информацию в пределах своей компетенции;
20) проводит разъяснительную работу по вопросам, относящимся к компетенции Фонда;
21) осуществляет целевое финансирование лечебно-профилактических учреждений, входящих в систему обязательного медицинского страхования;
22) ведет базы данных и иные информационные ресурсы по обязательному медицинскому страхованию;
23) осуществляет другие мероприятия по организации обязательного медицинского страхования граждан;
24) осуществляет финансирование обеспечения мер по реализации на территории Забайкальского края приоритетного национального проекта в сфере здравоохранения в порядке, установленном федеральным законодательством.