В последние годы наблюдается рост заболеваемости практически среди всех возрастных групп и по большинству классов заболеваний. Это хронические неинфекционные заболевания (сердечно - сосудистая и эндокринная патология, болезни органов дыхания, пищеварения), травмы, злокачественные новообразования и социально обусловленные болезни, наиболее значимой проблемой из которых является туберкулез.
Заболеваемость туберкулезом с 1994 года выросла в 3 - 5 раз. Серьезной угрозой в связи с ростом шприцевой наркомании и половой распущенностью становится распространение ВИЧ-инфекции, венерических заболеваний и вирусного гепатита. В 2000 году число ВИЧ-инфицированных выросло в 400 раз по сравнению с 1995 годом.
Воздействие кризисных факторов (резкое снижение уровня жизни, мощный психологический стресс, ухудшение работы системы здравоохранения) привело не только к снижению рождаемости, но и к росту смертности в республике.
Смертность среди сельских жителей выше, чем у городских. Смертность мужчин превышает смертность женщин, как в городской, так и сельской местности. Это сформировало беспрецедентный - почти в 12 лет разрыв в средней продолжительности жизни между мужчинами и женщинами. В целом, средняя продолжительность жизни жителей республики (64,4 лет) на 0,6 лет выше по сравнению с регионами Восточной Сибири, но на 2 года ниже, чем по стране и на 5 - 10 лет, чем в развитых странах.
Сохраняется неблагоприятная ситуация по младенческой и материнской смертности. В республике за 2000 год произошел их рост на 14 и 24 процентов соответственно по сравнению с 1995 годом.
Число дневных стационаров в области здравоохранения за 7 лет увеличилось с 41 до 74. Из 541 стационарозамещающих коек, 390 функционируют в сельских ЛПУ. Организовано 52 общеврачебных практик, в том числе 37 в районах. Число участковых больниц сократилось с 74 до 43, в то же время число врачебных амбулаторий увеличилось с 69 до 77. За этот же период число коек в круглосуточных стационарах сократилось на 333 (10530 в 1994 г. и 9197 в 2000 г.). В целом, обеспеченность койками близка к среднероссийскому уровню.
Темпы износа материальной базы опережают темпы реконструкции и нового строительства.
Оснащенность современным медицинским оборудованием не превышает 20%, а физический и моральный их износ превышает 65%. Требует замены стерилизационное оборудование, которое особенно необходимо в условиях высокой инфекционной заболеваемости (туберкулез, СПИД, вирусные гепатиты и др.).
Остается проблемой и кадровое обеспечение системы здравоохранения, в том числе медицинскими психологами, менеджерами. Незначителен приток молодых кадров по причине низкого уровня оплаты труда, слабой социальной защищенности медицинских работников.
В 2000 году по сравнению с 1994 годом, число врачей уменьшилось в 1,6 раза, а средних медицинских работников в 1,3 раза. Это свидетельствует о низкой обеспеченности врачами. Отмена государственного распределения и трудоустройства выпускников негативно сказалось на укомплектованности лечебных учреждений. Так, в 2000 году 6 участковых больниц и 21 врачебная амбулатория не имели врачей.
Здравоохранение Республики Бурятия, как и страны в целом, с начала рыночных реформ, осуществило переход от государственно - бюджетной системы к бюджетно - страховой.
Несмотря на проводимые преобразования, отрасль продолжает финансироваться по остаточному принципу, а функционировать по затратному. Во многом это связано с несовершенством управления здравоохранением в новых экономических условиях. Утрачен комплексный подход к охране здоровья, а сама система управления стала фрагментарной.
Несовершенна и существующая организационная модель медицинской помощи. Основной упор по-прежнему делается на дорогостоящую стационарную помощь в ущерб более экономичной амбулаторной, имеющей целью раннее обнаружение, своевременное лечение и профилактику заболеваний. Зачастую не выполняются декларированные государством гарантии на оказание бесплатной медицинской помощи населению. В результате население вынуждено платить все растущие суммы за те или иные необоснованные медицинские услуги.
Кроме того, лекарственная помощь из-за высоких цен на медикаменты стала малодоступной для большей части населения из-за низкого платежеспособного спроса. Постоянно растет число лиц, имеющих право на льготное лекарственное обеспечение.
С другой стороны, у населения сохраняется потребительское отношение к собственному здоровью, нет заинтересованности в его сохранении и укреплении, низки медицинская культура и социально - гигиенические навыки.