Координацию деятельности по реализации Программы осуществляет Комиссия при Правительстве Республики Бурятия по организации отдыха, оздоровления и занятости детей и подростков.
С учетом реализации программных мероприятий Министерство образования и науки Республики Бурятия уточняет объемы необходимых средств для их финансирования в отчетном году и представляет эти данные в Министерство финансов Республики Бурятия для формирования бюджетной заявки, в случае необходимости вносит предложения по уточнению и корректировке программных мероприятий, сроков их исполнения, а также по распределению и перераспределению финансовых средств.
Исполнители Программы обеспечивают организационное, методическое и информационное обеспечение мероприятий, разрабатывают необходимые для проведения мероприятий нормативные правовые документы.
В ходе реализации Программы Министерство образования и науки Республики Бурятия согласовывает с основными исполнителями Программы возможные сроки выполнения мероприятий, объемы их финансирования, обеспечивает согласованные действия исполнителей Программы по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств республиканского бюджета.
Механизм реализации Программы предусматривает формирование ежегодно рабочих документов (планов, смет на исполнение программных мероприятий).