Министерство здравоохранения Республики Бурятия и Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора в Республике Бурятия осуществляют управление и контроль за ходом выполнения Программы. Информация о ходе ее реализации направляется ими ежегодно в Правительство Республики Бурятия.