Организация мероприятий по предотвращению негативного воздействия вод и ликвидации его последствий в отношении водных объектов, находящихся в республиканской и федеральной собственности, расположенных на территории Республики Бурятия.
Обеспечение безопасности гидротехнических сооружений, находящихся в собственности Республики Бурятия, безопасности гидротехнических сооружений при использовании водных ресурсов и осуществлении природоохранных мероприятий (за исключением судоходных гидротехнических сооружений).
Охрана водных объектов, находящихся в республиканской собственности, а также водных объектов или их частей, находящихся в федеральной собственности и расположенных на территории Республики Бурятия.
Государственное управление, контроль, охрана и обеспечение функционирования особо охраняемых природных территорий регионального значения.
Управление участками недр, распоряжение которыми относится к компетенции Республики Бурятия.
Учет и контроль радиоактивных веществ и радиоактивных отходов в рамках системы государственного учета и контроля радиоактивных веществ.