Неблагополучная эпидемиологическая ситуация по особо опасным инфекционным заболеваниям людей и животных сохраняется. Ежегодно регистрируются случаи заболевания людей чумой, в том числе и в Республике Монголия. За период с 1997 по 1999 годы зарегистрировано 16 случаев заболевания людей чумой, из них 8 - с летальным исходом.
Проблема холеры, в связи с ее постоянной угрозой завоза на территорию Республики, сохраняет свою актуальность. Из воды поверхностных водоемов (реки Селенга, Куйтунка) в 1998 году выделено 9 культур холерных вибрионов Эль-Тор. Ежегодно выделяются неагглютинирующие штаммы холерных вибрионов, что свидетельствует о наличии условий для размножения вирулентных холерных вибрионов.
На территории Монголии после регистрации вспышки холеры в 1996 году, во время которой переболело 123 человека, умерло десять, шесть районов остаются неблагополучными. Учитывая интенсивные экономические, культурные связи, угроза завоза чумы, холеры в республику из Монголии и других неблагополучных стран, в том числе из стран СНГ, сохраняется.
В 1999 году в республике зарегистрирована крупнейшая в России вспышка сибирской язвы среди людей и животных, во время которой заболело 14 человек, из них 1 умер. На ликвидацию последствий эпидемии, для проведения экстренных противоэпизоотических, противоэпидемических и лечебных мероприятий было израсходовано более 2 млн. рублей.
В связи с ростом количества сельхозживотных в частном секторе, уменьшением объемов диагностических, профилактических мероприятий, сохраняется опасность заболевания людей и животных от зооантропонозных инфекций. Из-за недостаточного финансирования отмечается ежегодное снижение охвата диагностическими исследованиями сельхозживотных и людей, проведения профилактических прививок, не создается резерв иммунобиологических препаратов.
В связи с миграцией населения, интенсивным развитием международного туризма отмечается неблагополучная ситуация по малярии. С 1996 года в республике ежегодно регистрируются случаи малярии. В республике отсутствует запас противомалярийных препаратов. В условиях недостаточного финансирования в неполном объеме проводятся дератизационные, дезинсекционные мероприятия в природных очагах и населенных пунктах.
В текущем году отмечается рост заболеваемости ящуром - высококонтагиозным заболеванием сельхозживотных в Приморском крае России, в Казахстане, Монголии, Китае. Растет заболеваемость лептоспирозом.
Учитывая межхозяйственные связи с соседними регионами, в том числе с Монголией (откуда поступают мясо, живой скот на убой, для племенных и пользовательных целей), где практически отсутствует государственная ветеринарная служба, возрастает угроза завоза зооантропонозных инфекций.
Для обеспечения санитарно - эпидемиологического благополучия по охране территории республики от завоза и распространения особо опасных инфекционных заболеваний необходимо принятие постановления Правительства Республики Бурятия "О пролонгации республиканской целевой программы "Охрана территории Республики Бурятия от завоза и распространения особо опасных инфекционных заболеваний людей и животных" на 2001 - 2004 годы".