Рыбохозяйственный фонд водоемов Республики Бурятии: реки - 18300 км, озера - 2812,5 тыс. га. Основными рыбохозяйственными водоемами являются озеро Байкал с озерно - соровой системой, Гусино - Убукунская, Еравно - Харгинская и Ципо - Ципиканская (Баунтовская) системы озер, а также отдельные разрозненные озера в бассейнах рек, впадающих в Байкал.
На открытый Байкал, в пределах Бурятии, приходится 2430 тыс. га. Промысловое значение имеет лишь его мелководная часть глубиной до 100 м, где промышляют омуля в летний период нагула. Площадь этой зоны составляет всего 322 тыс. га или 13,2% площади озера в пределах Бурятии.
Из озер Гусино - Убукунской системы рыбопромысловое значение имеет только оз. Гусиное (16,5 тыс. га).
Система Ципо - Ципиканских озер (около 40 тыс. га) осваивается в недостаточной степени в связи с большой разбросанностью и удаленностью озер друг от друга.
На большей части водоемов Еравно - Харгинской системы озер создано озерное товарное хозяйство, некоторые из озер используются как питомники для подращивания молоди сиговых рыб.
Наибольшее рыбохозяйственное значение как по величине уловов, так и по уникальности и ценности видового состава обитающих рыб, имеет озеро Байкал. Одним из основных промысловых видов рыб озера является омуль. Для его воспроизводства создана мощная рыбоводная база по искусственному воспроизводству - проектная мощность рыбоводных заводов к настоящему времени достигла 3,75 млрд. икринок.
Сохранение уникального природного комплекса озера Байкал и вместе с тем эффективное использование его сырьевой базы - первоочередная задача сегодняшнего дня.
Сырьевой запас рыбных ресурсов в Бурятии составляет 21,7 тыс. тонн, из них на долю Байкала приходится 17,7, что позволяет планировать возможные уловы рыбы в объемах 5,3 и 4,5 тысяч. Основу уловов составляют мелкочастиковые (плотва, елец, окунь и др.) и сиговые (байкальский омуль, пелядь). Их промысловые запасы довольно стабильны.
Программа развития рыбного хозяйства Республики Бурятия до 2005 года предусматривает использование естественного биопродукционного потенциала водоемов, широкомасштабное воспроизводство байкальского омуля, осетра и других ценных видов рыб (пелядь, сиг, сазан), совершенствование озерного товарного рыбоводства, начало внедрения тепловодного рыбоводства, модернизацию рыбного промысла и технологии переработки рыбы.
Для сохранения масштабов воспроизводства рыбных запасов на водоемах Бурятии и повышения его экологичности требуется укрепление материально - технической базы существующих рыбоводных предприятий, проведение реконструкции, создание новых воспроизводственных комплексов. В период 2000 - 2005 гг. необходимо провести реконструкцию Селенгинского ЭРВЗ (первоочередные задачи - завершение строительства береговой садковой базы для сбора омулевой икры, строительство маточных прудов площадью 3,75 га для длительного содержания производителей осетра), строительство стационарной садковой базы на Баргузинском рыбоводном заводе, сазаньего рыбопитомника на оз. Гусином и Северобайкальского рыбоводного завода, а также мелиоративные работы на озере - питомнике Никиткино.
Реализация Программы пастбищного рыбоводства позволит существенно увеличить объем добычи рыбы:
по Байкалу: омуля - 730 тонн, осетра - 302 тонны;
по Еравно - Харгинским озерам: пеляди - 215 тонн, сазана - 385 тонн;
по Гусино - Убукунским озерам: омуля - 182 тонны, сига - 142 тонны и сазана - 59 тонн.
В настоящее время в условиях изменившихся взглядов на собственность и рыночных отношений возникает потребность в оценке перспектив использования в рыбном хозяйстве малых озер, в т.ч. создание фермерских рыбоводных хозяйств. Численность озер площадью от 50 до 1000 га в Бурятии достигает нескольких сотен. Даже при экстенсивном ведении хозяйства на этих площадях можно выращивать не менее 200 тонн таких видов рыб, как карп, сазан, пелядь, омуль и др.
Необходимо расширять и внедрять работы по формированию и эксплуатации ремонтно - маточных стад байкальского осетра на теплых водах Гусиноозерской ГРЭС с целью воспроизводства и выпуска молоди в озеро Байкал, а также, в дальнейшем, для нужд товарного осетроводства. Развитие карповодства, лососеводства на предприятиях ГРЭС, ТЭЦ, ЦКК.
Рыбодобывающие предприятия необходимо оснастить новым добывающим и обслуживающим флотом, неводовыборочными машинами, средствами механизации добычи рыбы и ее переработки, автотранспортом.
Учитывая, что традиционно байкальский омуль выпускался в соленом виде, а продукция в настоящее время не пользуется большим спросом, необходима перестройка перерабатывающей базы на выпуск мороженой продукции, а также разнообразной продукции в вакуумной упаковке.
Государственное управление использованием рыбных ресурсов должно быть реализовано через усиление органов рыбоохраны для эффективного контроля за промыслом рыбы. Кроме того, за государственный счет необходимо создать на важнейших водоемах сеть экологического мониторинга состояния среды и рыбных ресурсов.
Должны быть четко урегулированы все правовые вопросы промысла рыбы, а также приоритетное право рыбного хозяйства на использование водоемов.
Для финансового обеспечения реализации программы необходимо предусмотреть соответствующее выделение средств из республиканского бюджета, и в основном, из федерального бюджета. Часть средств может быть получена за счет взыскания долга с предприятий за ущерб, нанесенный рыбным запасам.