Финансирование мероприятий Программы осуществляется как за счет средств областного бюджета, так и путем привлечения средств федерального бюджета. Финансовое обеспечение Программы будет осуществляться согласно перечню мероприятий Программы (приложения 2 и 4 к Программе) в пределах бюджетных лимитов 2011-2015 годов, объем которых подлежит ежегодному уточнению. Основные расходы областного бюджета направлены на создание инфраструктуры, необходимой для обеспечения условий безопасной жизнедеятельности населения, проживающего на загрязненных территориях.
Структура финансирования Программы и финансово-экономического обоснования представлены в приложениях 2 и 3 к Программе.