5.1. Управление возглавляет начальник управления, который назначается и освобождается от должности Губернатором области по представлению руководителя Аппарата Губернатора и администрации области.
Кандидатура на должность в установленном порядке согласовывается с заместителем Губернатора области, курирующим природоохранный комплекс.
5.2. В отсутствие начальника управления его обязанности исполняет заместитель начальника управления.