5.1. Центр возглавляет начальник в ранге заместителя министра социальной политики Чувашской Республики, назначаемый на должность и освобождаемый от нее распоряжением Кабинета Министров Чувашской Республики по представлению министра социальной политики Чувашской Республики.
5.2. Начальник руководит деятельностью Центра, несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Центр задач и функций.
5.3. Начальник назначает и освобождает в установленном порядке от должности работников Центра, издает приказы, дает указания по вопросам, входящим в его компетенцию, обязательные для выполнения работниками Центра, осуществляет другие полномочия в соответствии с действующим законодательством.
5.4. Аппарат управления Центра финансируется за счет средств республиканского бюджета Чувашской Республики, его предельная численность и фонд оплаты труда утверждаются Кабинетом Министров Чувашской Республики.