Программа реализуется за счет средств республиканского бюджета Чувашской Республики и других источников.
Общий объем ассигнований на финансирование составляет 16803,3 тыс. рублей, в том числе за счет средств республиканского бюджета Чувашской Республики 2647,2 тыс. рублей, средств ФОМС 12556,1 тыс. рублей (по согласованию), местных бюджетов 1600 тыс. рублей. Объем финансирования Программы подлежит ежегодной корректировке исходя из возможностей бюджетов всех уровней.