Основными задачами Министерства являются:
разработка в пределах своей компетенции основ государственной политики Чувашской Республики в области здравоохранения, реализация федеральных целевых программ по развитию здравоохранения, разработка и реализация республиканских программ по профилактике заболеваний, оказанию медицинской помощи обеспечению населения лекарственными средствами, медицинской техникой и изделиями медицинского назначения;
организация оказания медицинской помощи населению;
обеспечение функционирования подведомственной системы специального профессионального образования в области здравоохранении;
координация, обеспечение методического руководства и осуществление взаимодействия государственной, в том числе находящейся в введении органов исполнительной власти Чувашской Республики, муниципальной и частной систем здравоохранения;
организация проведения научных исследований, внедрение достижений науки и техники в медицинскую практику;
контроль за соблюдением нормативов и стандартов в области здравоохранения, включая медицинскую помощь, фармацевтическую деятельность;
контроль за качеством предоставленной населению медицинской помощи, производством, качеством, эффективностью и безопасностью лекарственных, диагностических, дезинфекционных средств, иммунобиологических препаратов, изделий медицинского назначения и медицинской техники;
охрана здоровья матери, отца и ребенка
профилактика инвалидности и медицинская реабилитация инвалидов;
координация работы и методическое руководство деятельностью подведомственных республиканских унитарных предприятий и учреждений, анализ результатов их деятельности на заседаниях балансовой комиссии;
контроль за экономическими показателями эффективности деятельности подведомственных республиканских унитарных предприятий и учреждений, утверждение их годовой бухгалтерской отчетности, определение основных направлений использования чистой прибыли, остающейся в их распоряжении