Реализация подпрограммы подвержена влиянию рисков и негативных факторов.
Несмотря на позитивные тенденции последнего времени, сохраняется высокая степень неопределенности относительного того, как и какими темпами будет проходить восстановление мировой экономики после периода глубокой глобальной рецессии. Существующий риск ухудшения состояния экономики может привести к снижению бюджетных доходов, ухудшению динамики основных макроэкономических показателей, в том числе повышению инфляции, снижению темпов экономического роста. Неопределенность в этом вопросе будет снижать интерес инвесторов к более рискованным проектам, в связи с этим они будут придерживаться более консервативного поведения при выборе мест приложения своим капиталам.
Отсутствие финансирования либо финансирование в недостаточном объеме мероприятий подпрограммы, в том числе из внебюджетных источников, может привести к затруднению реализации запланированных мероприятий подпрограммы.
К рискам реализации подпрограммы, которыми могут управлять ответственный исполнитель и соисполнители подпрограммы, уменьшая вероятность их возникновения, можно отнести риски неполной реализации планов мероприятий ("дорожных карт") по обеспечению благоприятного инвестиционного климата в республике и развитию конкуренции в приоритетных отраслях, отсутствие у органов исполнительной власти Чувашской Республики намерений по реализации планов мероприятий ("дорожных карт") в курируемых сферах деятельности.
Существуют также организационные риски, которые связаны с возникновением проблем в реализации подпрограммы в результате недостаточной квалификации и (или) недобросовестности ответственных исполнителей (соисполнителей), что может привести к нецелевому и неэффективному использованию бюджетных средств. Снижению указанных рисков будут способствовать повышение квалификации и ответственности персонала ответственного исполнителя и соисполнителей для своевременной и эффективной реализации предусмотренных мероприятий, координация деятельности персонала ответственного исполнителя и соисполнителей и налаживание административных процедур для снижения организационных рисков.