Основными функциями Комиссии являются:
3.1. Организация постоянного мониторинга выполнения мероприятий Проекта.
3.2. Выработка предложений по корректировке Плана использования средств субзайма.
3.3. Анализ результатов реализации Проекта.
3.4. Разработка рекомендаций по совершенствованию нормативной и правовой базы в целях эффективной реализации Проекта.
3.5. Рассмотрение и утверждение отчетов о работе ГУЗ "Центр реализации программ и проектов".
3.6. Согласование программ Проекта и их исполнителей на конкурсной основе в пределах компетенции Комиссии.