1. Средства Фонда имеют строго целевое назначение и используются на финансирование мероприятий по воспроизводству минерально-сырьевой базы, воспроизводству и охране водных объектов, включающих в себя:
геолого-геофизические, геолого-съемочные и поисково-оценочные работы;
государственные гидрогеологическую, инженерно-геологическую и геоэкологическую съемки;
работы специального геологического назначения;
государственное геологическое информационное обеспечение;
воспроизводство и охрану подземных пресных и термальных вод;
систематизацию, учет и хранение образцов горных пород, отбираемых при проведении геологоразведочных работ, включая содержание геологического музея;
возмещение землепользователям убытков, причиненных изъятием или временным занятием земельных участков при осуществлении геологоразведочных работ;
обустройство баз предприятий, организаций и учреждений, включая строительство и приобретение жилья и объектов социальной сферы, создание баз строительной индустрии, содержание социальной сферы, строительство, реконструкцию и ремонт зданий и сооружений, производственных и непроизводственных, включая коммуникации и инженерное оборудование в пределах средств, предусмотренных на эти цели в утвержденной проектно-сметной документации;
работы, связанные с ликвидацией геологических осложнений и пожаров, в пределах средств, предусмотренных на эти цели в утвержденной проектно-сметной документации;
содержание законченных бурением, опробованных и законсервированных нефтяных и газовых скважин на нераспределенном фонде недр, зернохранилищ, наблюдательных станций и постов, средств связи;
техническое перевооружение, производство и приобретение специальной техники, транспортных средств, приборов и оборудования, полевого и экспедиционного снаряжения и другого имущества;
научно-исследовательские, опытно-конструкторские и проектные работы в области природопользования;
мониторинг и охрану геологической и водной среды;
экспертизу проектно-сметной документации;
совершенствование экономического механизма природопользования;
выплату вознаграждений за открытие и разведку месторождений полезных ископаемых, активное участие в осуществлении государственного контроля геологической и водной среды;
затраты по управлению государственным фондом недр и водным фондом, содержание службы государственного геологического и водного контроля, контрольно-ревизионной службы, территориального геологического фонда;
организацию ведения банка данных государственного мониторинга водных объектов;
рекламно-издательские расходы;
организацию обеспечения населения и объектов экономики качественной водой;
предупреждение и ликвидацию последствий вредного воздействия паводков, подтопления, водной эрозии;
охрану и рациональное использование водных ресурсов, восстановление малых рек;
установление водоохранных зон и соблюдение режима хозяйственной деятельности в пределах этих зон;
осуществление государственного контроля за безопасностью водохозяйственных и гидротехнических сооружений;
обеспечение устойчивого и безопасного функционирования водохозяйственных систем.
2. Расходы на финансирование работ по геологическому изучению недр и воспроизводству минерально-сырьевой базы, воспроизводству и охране водных объектов при формировании бюджета Фонда определяются по прошедшей государственную экспертизу проектно-сметной документации на производство работ, составленной по каждому геологическому (техническому) заданию, и договорным ценам, которые не могут быть выше цен утвержденной проектно-сметной документации в сопоставимых ценах.
3. Расходование средств Фонда, передаваемых предприятиям и организациям, осуществляется по проектно-сметной документации на производство работ по каждому объекту, утвержденной в установленном порядке государственным заказчиком или организацией, которой в соответствии с действующим законодательством по договору передана Министерством природных ресурсов Российской Федерации часть функций государственного заказчика.