Механизм реализации подпрограммы базируется на принципах социального партнерства сельского населения, исполнительных органов государственной власти Республики Саха (Якутия), органов местного самоуправления и хозяйствующих субъектов, а также четкого разграничения полномочий и ответственности всех участников подпрограммы.
Порядок предоставления субсидий за счет средств государственного бюджета Республики Саха (Якутия) определен Правительством Республики Саха (Якутия).
Текущее управление реализацией подпрограммы осуществляет Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Саха (Якутия), являющееся ответственным исполнителем.
Ответственный исполнитель обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств государственного бюджета Республики Саха (Якутия), выполнению соглашений с муниципальными образованиями республики о финансировании программных мероприятий за счет средств местных бюджетов и внебюджетных источников, составляет и в установленном порядке представляет бюджетную заявку на субсидии из федерального и государственного бюджета Республики Саха (Якутия) для финансирования подпрограммы на очередной финансовый год, подготавливает аналитические доклады о ходе ее реализации.
В ходе выполнения подпрограммы ответственный исполнитель осуществляет взаимодействие с исполнительными органами государственной власти Республики Саха (Якутия) в рамках отдельных мероприятий подпрограммы.
Ежегодно ответственный исполнитель подпрограммы с участием заинтересованных исполнительных органов государственной власти Республики Саха (Якутия), органов местного самоуправления республики подготавливает и до 1 марта каждого года представляет в Министерство экономики Республики Саха (Якутия) доклад о ходе реализации подпрограммы за прошедший год.