1. Организационное обеспечение работы Комиссии, прием, учет, подготовку, хранение ее материалов осуществляет республиканский орган управления государственным фондом недр. При необходимости этот орган обеспечивает государственную экспертизу материалов, поступающих в Комиссию.
2. Работа Комиссии в целом проводится на заседаниях, руководство которыми осуществляет председатель комиссии или его заместитель. Между заседаниями комиссии ее функционирование осуществляет республиканский орган управления государственным фондом недр. Делопроизводство комиссии ведет секретарь, назначаемый от органа управления государственным фондом недр.
3. Заседания комиссии проводятся не реже одного раза в квартал при явке более половины ее членов от списочного состава. Решение оформляется протоколом и считается принятым, если за него проголосовало большинство членов комиссии (50% плюс один голос) от списочного состава комиссии. При результатах голосования 50% на 50% председатель комиссии имеет решающий голос. Члены комиссии, несогласные с принятым решением, могут письменно мотивировать свою позицию, которая прилагается к протоколу. Протокол подписывается председателем или его заместителем и секретарем.
4. Председатель (или заместитель) Комиссии может через республиканский орган управления государственным фондом недр привлекать для решения отдельных вопросов, возникающих в ходе работы Комиссии, или консультаций квалифицированных специалистов и экспертов.