Управление ходом исполнения Программы возлагается на местные органы исполнительной власти и министерства, ответственные за создание новых рабочих мест:
Министерство материальных ресурсов, торговли, транспорта и связи (торговля и общественное питание, мебельное производство, легкая промышленность, транспорт, связь);
Министерство сельского хозяйства и заготовок (пищевая и перерабатывающая промышленность, семейные и крестьянские хозяйства);
Министерство промышленности (добыча драгоценных металлов и камней, алмазогранильное и ювелирное производство, машиностроение и металлообработка);
Министерство топливной промышленности и энергетики (угольная промышленность);
Министерство малого предпринимательства и развития занятости, Департамент федеральной государственной службы занятости населения (малое предпринимательство).
Координирует работу по созданию новых рабочих мест Координационный совет содействия занятости при Правительстве Республики Саха (Якутия).
Персональная ответственность за исполнение Программы возлагается на глав администраций улусов и городов республики.