Министерство имеет право:
4.1. Осуществлять в пределах своей компетенции разработку и принятие нормативных правовых актов: приказов, распоряжений Министерства, обязательных для выполнения органами управления образованием и образовательными учреждениями.
4.2. Осуществлять в установленном порядке согласование назначения и увольнения руководителей муниципальных органов управления образованием.
4.3. Вносить предложения в Правительство Республики Саха (Якутия) по созданию, реорганизации и ликвидации подведомственных образовательных учреждений.
4.4. Осуществлять права учредителя государственных образовательных учреждений.
4.5. Образовывать в необходимых случаях комиссии и экспертные советы, а также временные научные (творческие) коллективы и рабочие группы, финансировать их деятельность.
4.6. Приостанавливать в установленном порядке деятельность подведомственных образовательных учреждений, осуществляемую с нарушениями требований законодательства Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) в области образования и уставов образовательных учреждений.
4.7. Отстаивать и защищать интересы и права учреждений образования, педагогических работников в соответствии с действующим законодательством.
4.8. Запрашивать и получать в установленном порядке от республиканских органов исполнительной власти, органов местного самоуправления, учреждений и организаций (независимо от их организационно-правовой формы и ведомственной принадлежности) сведения, материалы и документы, необходимые для осуществления возложенных на Министерство задач и функций.
4.9. Участвовать в порядке, установленном законодательством Республики Саха (Якутия) и Российской Федерации, в учреждении организаций для поддержки развития образования и научно-технической деятельности, в том числе международных.