6.1 Госкомсанэпиднадзор возглавляет председатель, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Указом Президента Республики Саха (Якутия).
6.2. Председатель Госкомсанэпиднадзора имеет первого заместителя и заместителя. Заместители председателя назначаются и освобождаются от должности в порядке, установленном Президентом Республики Саха (Якутия).
6.3. Председатель Госкомсанэпиднадзора по должности является Главным государственным санитарным врачом по Республике Саха (Якутия), а его заместители - заместителями Главного государственного санитарного врача по Республике Саха(Якутия).
6.4. Председатель Госкомсанэпиднадзора:
6.4.1. Осуществляет на основе единоначалия руководство деятельностью Госкомсанэпиднадзора, организует выполнение возложенных на него задач и несет персональную ответственность за их выполнение.
6.4.2. Распределяет обязанности между заместителями председателя и руководителями структурных подразделений Госкомсанэпиднадзора и устанавливает степень их ответственности за руководством отдельными областями деятельности, а также за работу учреждений Госкомсанэпиднадзора.
6.4.3. Утверждает в пределах установленной численности и фонда оплаты труда работников аппарата Госкомсанэпиднадзора структуру, штатное расписание и положение о его структурных подразделениях, а также смету расходов на его содержание в пределах утвержденных на соответствующий период ассигнований, а также положения учреждений Госкомсанэпиднадзора, с учетом реализации нормативных актов Президента и Правительства Республики Саха(Якутия) относительно порядка формирования структуры органов исполнительной власти и соотношения категорий должностей государственных служащих.
6.5. В Госкомсанэпиднадзоре образуется коллегия в составе председателя Госкомсанэпиднадзора (председателя коллегии), его заместителей, руководящих работников Госкомсанэпиднадзора и его подведомственных учреждений, руководителей и работников других министерств, ведомств, научных учреждений.
Члены коллегии утверждаются распоряжением Правительства Республики Саха (Якутия).
6.6. При Госкомсанэпиднадзоре создаются на общественных началах советы и комиссии, работа которых направлена на решение производственных вопросов и проведение экспертизы специальных научно-производственных проблем.
6.7. Финансирование расходов на содержание аппарата Госкомсанэпиднадзора осуществлять за счет средств республиканского бюджета Республики Саха (Якутия) на содержание органов исполнительной власти республики. Лимит численности работников, включая обслуживающий персонал, утверждается Указом Президента Республики Саха (Якутия) в установленном порядке.
6.8. Реорганизация (слияние, присоединение, разделение, выделение) и прекращение деятельности Госкомсанэпиднадзора производится Указом Президента Республики Саха (Якутия).