Управление реализацией Программы осуществляется ответственными государственными исполнителями Программы уполномоченным Правительством Республики Саха (Якутия), которыми ежегодно составляется подробный календарный план по реализации Программы с разделением функций.
Ежемесячно исполнители Программы представляют оперативную отчетность о ходе реализации Программы ответственным государственным исполнителям, для оперативного решения проблемных вопросов. Государственные заказчики программы в свою очередь, в установленном порядке представляют отчет о ходе реализации Программы и принятии мер по решению проблемных вопросов.
Контроль за ходом реализации данной Программы осуществляется Правительством Республики Саха (Якутия).