Управление реализацией Программы осуществляет Министерство сельского хозяйства и продовольственной политики Республики Саха (Якутия), которое:
координирует деятельность исполнителей Программы, обеспечивает своевременную и качественную реализацию мероприятий Программы, осуществляет мониторинг выполнения мероприятий Программы, сбор статистической и аналитической информации о реализации программных мероприятий;
направляет бюджетные заявки на финансирование мероприятий на очередной финансовый год;
ежегодно уточняет объемы целевых индикаторов (показателей) эффективность реализации Программы, объем необходимых ассигнований на реализацию программных мероприятий, механизм реализации Программы и состав исполнителей;
с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации, главами органов местного самоуправления муниципальных районов и городских округов Республики Саха (Якутия), с другими участниками Программы в установленном порядке заключает соглашения по реализации мероприятий Программы, где предусматриваются обязательства по финансированию мероприятий Программы за счет средств федерального, республиканского, муниципального бюджетов и привлеченных внебюджетных средств (собственных средств участников и кредитных ресурсов), а также обязательства по выполнению мероприятий Программы и достижению установленных показателей;
проводит ежегодную оценку эффективности реализации Программы;
осуществляет контроль реализации Программы в соответствии с действующим законодательством.
При реализации целей и задач Программы осуществляются меры, направленные на предотвращение негативного воздействия рисков и угроз, на достижение предусмотренных в ней конечных результатов.
К указанным рискам и угрозам относятся:
макроэкономические факторы, в том числе рост цен на энергоресурсы и другие материально-технические ресурсы, потребляемые в отрасли, что ограничивает возможности у значительной части сельскохозяйственных товаропроизводителей осуществлять инвестиционные и инновационные проекты, переход к новым ресурсосберегающим технологиям;
отставание социальной инфраструктуры сельских территорий от городов и промышленных центров, доходов занятых сельскохозяйственной деятельностью - от уровня у работников других сфер экономики, падение привлекательности труда в сельском хозяйстве, и, как следствие, отток квалифицированных кадров, особенно молодежи, из сферы сельскохозяйственной деятельности, потеря чувства перспективы у значительной части сельского населения;
сокращение численности поголовья дойных кобыл, которая приведет к уменьшению объема заготовки кобыльего молока на местах.
При необходимости органами финансового контроля осуществляется контроль за целевым и эффективным использованием средств, выделяемых из государственного бюджета Республики Саха (Якутия) и федерального бюджета Российской Федерации на реализацию программы.