4.1. Территория национального парка подразделяется на 2 зоны охраны:
- зона особой охраны;
- зона рекреации и массового отдыха.
1. Зона особой охраны. Включает акваторию озера Сайсары и водной системы, обеспечивающей проточность озера и их водоохранную зону.
На территории зоны особой охраны запрещается:
- действия, изменяющие гидрологический и гидрохимический режим озера и ее проточности;
- другие виды деятельности, изменяющие и нарушающие природные и существующие комплексы парка или влекущие за собой снижение природной и культурной ценности его территории.
На территории особой охраны допускается:
- летние и зимние рекреации (катание на лодках, использование в виде катка без полива);
- научные мониторинговые исследования, проводимые по темам, согласованным с Министерством охраны природы Республики Саха;
- строительство объектов, необходимых для деятельности парка и входящих в перечень генерального плана.
2. Зона рекреации и массового отдыха, Включает территории ипподрома и радиополя.
В зоне рекреации и массового отдыха запрещается:
- строительство объектов, за исключением необходимых для деятельности национального парка.
4,2. В национальном парке проводятся мероприятия, необходимые для сохранения или восстановления природных комплексов и объектов, повышения рекреационных и эстетических качеств местности.
Научные исследования проводятся по темам, согласованным с Министерством охраны природы Республики Саха.
4.3. На территории национального парка устанавливается дифференцированный режим охраны и использования. При этом учитывается сохранность природных комплексов, характер ландшафта, состояние объектов животного и растительного мира, с учетом местных природных, историко-культурных и социальных особенностей.