Основными задачами являются:
2.1. Осуществление функций государственного управления и контроля в области охраны окружающей среды в Республике Саха (Якутия), проведение единой научно-технической политики по вопросам охраны окружающей среды и неистощительного использования природных ресурсов.
2.2. Участие в разработке и реализации государственной политики Российской Федерации в области охраны окружающей среды и экологических программ с учетом географических, природных, социально-экономических и иных особенностей Республики Саха (Якутия).
2.3. Участие в разработке и реализации государственной политики Российской Федерации и федеральных программ в области обеспечения радиационной безопасности.
2.4. Организация разработки и реализация республиканских программ по охране окружающей среды и рациональному использованию природных ресурсов, участие в разработке и реализации соответствующих федеральных целевых программ.
2.5. Координация деятельности министерств, ведомств, предприятий, учреждений и организаций Республики Саха (Якутия) в области охраны окружающей среды.
2.6. Оценка и прогнозирование антропогенного и техногенного воздействия на окружающую среду, а также состояния и использования природных ресурсов.
2.7. Регулирование природопользования в пределах своей компетенции совместно со специально уполномоченными органами исполнительной власти Республики Саха (Якутия) и федеральными специально уполномоченными государственными органами в целях охраны окружающей среды.
2.8. Разработка проектов законов и иных нормативных правовых актов Республики Саха (Якутия) в области охраны окружающей среды, содержащих требования, нормы и правила не ниже установленных на федеральном уровне и учитывающих региональную природную специфику территории республики.
2.9. Ведение государственного мониторинга источников антропогенного воздействия на окружающую среду, мониторинга животного и растительного мира, водной и воздушной сред; формирование и обеспечение функционирования территориальных систем наблюдения за состоянием окружающей среды на территории Республики Саха (Якутия).
2.10. Разработка и координация природоохранных мероприятий в зонах экологического неблагополучия и бедствия в рамках своих полномочий.
2.11. Организация и развитие системы экологического просвещения и формирование экологической культуры населения.
2.12. Обеспечение населения, органов государственной власти Республики Саха (Якутия) и органов местного самоуправления достоверной информацией о состоянии окружающей среды.
2.13. Организация природно-заповедного дела, формирование государственного Кадастра особо охраняемых природных территорий Республики Саха (Якутия), ведение Красной Книги Республики Саха (Якутия), участие в ведении Красной книги Российской Федерации.
2.14. Участие в реализации обязательств Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) в сфере охраны окружающей среды, вытекающих из членства в международных организациях и участия в международных договорах.
2.15. Развитие и эффективное использование материально-технической базы для осуществления целей и задач, возложенных на Минприроды РС(Я).
2.16. Организация реализации Соглашений между Правительствами Российской Федерацией, субъектов Российской Федерации, Республики Саха (Якутия) и органами местного самоуправления в области использования природных ресурсов и охраны окружающей среды.