Фонд осуществляет контроль за ходом реализации Программы и целевым использованием финансовой поддержки, проводит мониторинг реализации Программы в соответствии полномочиями, установленными Федеральным законом от 21.07.2007 N 185-ФЗ.
Правительство Республики Саха (Якутия) контролирует исполнение мероприятий Программы Государственным заказчиком, Уполномоченным органом и Участниками Программы. Рассматривает вопросы реализации Программы на заседаниях Правительства Республики Саха (Якутия).
Государственный заказчик Программы координирует и контролирует исполнение мероприятий Программы Участниками Программы, проводит мониторинг реализации Программы. Является ответственным органом исполнительной власти Республики Саха (Якутия) по работе с Фондом. Представляет необходимые отчеты о реализации Программы в Фонд в установленные сроки, готовит и вносит на утверждение Президенту Республики Саха (Якутия) квартальные (годовые) отчеты для предоставления в Фонд.
Уполномоченный орган осуществляет мероприятия по финансированию Программы, контролирует расходование средств Участниками Программы, предоставляет отчетность о расходовании средств финансовой поддержки в Фонд.
Участники Программы - основные исполнители мероприятий Программы, подконтрольны Правительству Республики Саха (Якутия) и Государственному заказчику, осуществляют мероприятия Программы с соблюдением установленных сроков, ответственны за исполнение Программы. Представляют отчеты о реализации Программы Государственному заказчику и расходовании Уполномоченному органу в установленные сроки. В случае, если Участником Программы является муниципальный район, взаимодействие между муниципальным районом и муниципальным поселением, на балансе которого расположены аварийные многоквартирные дома, осуществляется посредством заключения соглашения.
Взаимодействие по реализации Программы Государственного заказчика и Участников Программы осуществляется путем заключения соглашения, исполнение (неисполнение) обязательств по которому регулируется действующим законодательством.