Управление реализацией Программы осуществляются государственными заказчиками.
Министерство труда и социальной защиты населения РС(Я), Министерство строительства и архитектуры РС(Я), как государственные заказчики Программы, совместно с Министерством экономики и прогнозирования РС(Я), Министерством финансов РС(Я) и другими заинтересованными министерствами и ведомствами Республики Саха (Якутия) осуществляют организацию выполнения Программы и контроль за этим.
На заседаниях Комиссии при Правительстве Республики Саха (Якутия) по вопросам организации выезда граждан из Республики Саха (Якутия) постоянно должны рассматриваться вопросы о ходе реализации программных мероприятий и об эффективности использования финансовых средств.
Информация и доклады о ходе выполнения Программы и об использовании средств за счет всех источников финансирования представляются в установленном порядке.