Механизм реализации Программы определяется государственным заказчиком Программы в лице Департамента по охране генофонда народов Республики Саха (Якутия) Министерства охраны природы Республики Саха (Якутия). К участию в реализации Программы привлекаются органы и учреждения науки, здравоохранения.
Механизм реализации Программы включает в себя:
организационные мероприятия, обеспечивающие планирование, реализацию и контроль исполнения предусмотренных Программой работ;
контроль исполнения предусмотренных Программой работ;
методические и информационные мероприятия.
Основными исполнителями программы являются ЯНЦ РАМН и Правительства Республики Саха (Якутия), Министерство здравоохранения Республики Саха (Якутия), Департамент по охране генофонда народов Республики Саха (Якутия) Министерства охраны природы Республики Саха (Якутия).