Основными задачами Министерства являются:
2.1. Разработка и реализация государственной политики по развитию и поддержке транспортного комплекса и дорожного хозяйства Республики Саха (Якутия) в соответствии с полномочиями, указанными в пункте 1.1 настоящего Положения, направленной на максимальное удовлетворение спроса населения и потребностей государства в транспортных услугах при перевозках морскими и внутренними водными путями, по автомобильным и железным дорогам, в воздушном пространстве, развитие и улучшение транспортно-эксплуатационного состояния автомобильных дорог и водных путей общего пользования.
2.2. Формирование и проведение в транспортном комплексе и дорожном хозяйстве единой экономической, инвестиционной, научно-технической, информационной, кадровой и социальной политики.
2.3. Формирование и совершенствование правовых основ функционирования транспортного комплекса и дорожного хозяйства.
2.4. Разработка и реализация совместно с федеральными государственными органами, республиканскими органами исполнительной власти и органами местного самоуправления программ развития транспортного комплекса и дорожного хозяйства.
2.5. Обеспечение эффективного управления республиканской собственностью в транспортном комплексе и дорожном хозяйстве.
2.6. Содействие повышению эффективности работы организаций транспортного комплекса и дорожного хозяйства.
2.7. Организация оптимального взаимодействия различных видов транспорта.
2.8. Организация совместно с заинтересованными республиканскими органами исполнительной власти проведения ведомственных статистических наблюдений в транспортном комплексе и дорожном хозяйстве.
2.9. Осуществление в пределах своей компетенции государственного регулирования и управления деятельности хозяйствующих субъектов любой формы собственности по обеспечению безопасного, устойчивого и эффективного функционирования транспортного комплекса и дорожного хозяйства.
2.10. Реализация государственной политики по охране труда в транспортном комплексе и дорожном хозяйстве.
2.11. Взаимодействие в установленном порядке с полномочным представителем Президента Российской Федерации в Дальневосточном федеральном округе, органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации по вопросам формирования и реализации государственной политики в области развития транспортного комплекса и дорожного хозяйства.
2.12. Разработка и реализация мероприятий в области мобилизационной подготовки экономики Республики Саха (Якутия) в области транспортного комплекса и дорожного хозяйства.
2.13. Оказание государственных услуг в установленном порядке.