5.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Президентом Республики Саха (Якутия) по представлению Председателя Правительства Республики Саха (Якутия), с согласия Государственного Собрания (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия) в соответствии с действующим законодательством Республики Саха (Якутия).
Министр несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство задач и осуществление им своих функций.
5.2. Министр имеет семь заместителей, в том числе двух первых. Заместители министра назначаются на должность и освобождаются от должности в порядке, установленном Президентом Республики Саха (Якутия).
5.3. Министр экономики и промышленной политики Республики Саха (Якутия):
1) руководит деятельностью Министерства;
2) издает приказы и распоряжения, подлежащие обязательному исполнению работниками Министерства, а также находящимися в его ведении организациями;
3) распределяет обязанности между заместителями министра;
4) устанавливает обязанности и определяет ответственность руководителей структурных подразделений Министерства;
5) назначает на должность и освобождает от должности в установленном порядке сотрудников Министерства;
6) решает в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) о государственной службе вопросы, связанные с прохождением государственной службы в Министерстве;
7) утверждает положения о структурных подразделениях Министерства, а также в установленном порядке уставы (положения) находящихся в ведении Министерства предприятий, заключает в соответствии с законодательством Российской Федерации контракты с руководителями этих организаций;
8) утверждает структуру Министерства в пределах установленной численности и исходя из фонда оплаты труда с учетом реализации нормативных актов Президента и Правительства Республики Саха (Якутия) о порядке формирования структуры органов исполнительной власти и соотношении категорий должностей государственных гражданских служащих;
9) утверждает штатное расписание Министерства в соответствии с нормативами, установленными Правительством Республики Саха (Якутия), смету расходов в пределах утвержденных в государственном бюджете Республики Саха (Якутия) на соответствующий период бюджетных ассигнований на государственное управление;
10) представляет в установленном порядке особо отличившихся работников Министерства к присвоению почетных званий и награждению государственными наградами, учреждает в установленном порядке ведомственные награды, утверждает положения об этих наградах и их описание, награждает работников Министерства почетными грамотами, применяет меры морального и материального поощрения;
11) принимает решения о премировании работников Министерства на основании утверждаемого им Положения о премировании;
12) рассматривает предложения, заявления и жалобы граждан, сотрудников Министерства и принимает по ним необходимые меры, организует прием граждан по вопросам, отнесенным к его компетенции;
13) ведет заседания коллегии Министерства;
14) осуществляет другие права в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Саха (Якутия).
5.4. В Министерстве образуется коллегия в составе министра (председатель коллегии) и заместителей министра, входящих в нее по должности, а также руководителей и заместителей руководителей органов исполнительной власти Республики Саха (Якутия), органов местного самоуправления, представителей Государственного Собрания (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия), предприятий, научных и общественных организаций, руководителей ведущих подразделений Министерства. Состав коллегии утверждается распоряжением Правительства Республики Саха (Якутия).
5.5. Министерство может образовывать научно-консультативные и экспертные советы. Состав научно-консультативных и экспертных советов Министерства и положения о них утверждаются министром.
Организационно-техническое обеспечение указанных советов осуществляется Министерством в пределах утвержденной численности работников и ассигнований на содержание Министерства.