В соответствии с действующими нормативными актами государственный заказчик Программы - Министерство малого предпринимательства и развития занятости Республики Саха (Якутия) является органом, ответственным за реализацию государственной политики в области малого предпринимательства и развития занятости, а также за координацию деятельности государственных, негосударственных и общественных организаций, функционирующих в сфере малого предпринимательства.
Попечительский совет Фонда поддержки малого предпринимательства определяет первоочередность выполнения мероприятий Программы с учетом приоритетных направлений и наличия средств, выделенных на реализацию задач Программы.
Финансирование мероприятий Программы осуществляется через Фонд поддержки малого предпринимательства Республики Саха (Якутия) по решению Экспертного совета.
Контроль за выполнением мероприятий Программы осуществляет Министерство малого предпринимательства и развития занятости Республики Саха (Якутия) и Попечительский совет Фонда поддержки малого предпринимательства.