Целями осуществления мероприятий по проведению противоэпизоотических мероприятий являются предупреждение болезней сельскохозяйственных животных и их лечение, выпуск полноценных и безопасных в ветеринарном отношении продуктов животноводства и защита населения от болезней, общих для человека и животных.
Для обеспечения эпизоотического благополучия и получения безопасной продукции животноводства ставятся следующие задачи:
1. Недопущение вспышек зооантропонозов — особо опасных болезней, общих для человека и животных, таких, как сибирская язва, бешенство, туберкулез, бруцеллез, некробактериоз, лептоспироз, птичий грипп и другие.
2. Оздоровление хозяйств республики от лейкоза крупного рогатого скота, бруцеллеза и некробактериоза оленей, лептоспироза крупного рогатого скота, лошадей, бешенства животных на основании одобренных планов мероприятий Противоэпизоотической комиссией Правительства Республики Саха (Якутия).
3. Формирование и реализация федеральных и республиканских программ по предупреждению и ликвидации карантинных и особо опасных болезней животных.
4. Обеспечение производства безопасной продукции и сырья животного происхождения в ветеринарно-санитарном отношении.
5. Осуществление государственного ветеринарного надзора и контроля.