6.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Президентом Республики Саха (Якутия) по согласованию с Палатой Представителей Государственного Собрания (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия).
6.2. Министр несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство задач и осуществление им своих функций.
6.3. Министр имеет заместителей, в том числе одного первого заместителя, назначаемых на должность и освобождаемых от должности в порядке, установленном Президентом Республики Саха (Якутия).
6.4. Министр:
6.4.1. Руководит деятельностью Министерства.
6.4.2. Вносит в установленном порядке на рассмотрение Правительства Республики Саха (Якутия) проекты нормативно-правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию Министерства.
6.4.3. Издает распоряжения и приказы, утверждает документы и нормативы, не требующие рассмотрения в Правительстве.
6.4.4. Устанавливает обязанности заместителей министра и руководителей структурных подразделений Министерства.
6.4.5. Утверждает структуру и штатное расписание аппарата Министерства в соответствии с нормативами, установленными Правительством Республики Саха (Якутия), а также положения о структурных подразделениях Министерства, с учетом реализации нормативных актов Президента и Правительства Республики Саха (Якутия) относительно порядка формирования структуры органов исполнительной власти и соотношения категории должностей государственных служащих.
6.4.6. Принимает и увольняет в соответствии с Трудовым кодексом РФ и законами о государственной службе Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) государственных служащих и других работников аппарата Министерства.
6.5. В Министерстве образуется коллегия в составе министра, его заместителей, руководителей предприятий, проектных организаций, финансирующих банков, органов снабжения, высококвалифицированных специалистов строительного и лесопромышленного комплексов и представителей других министерств и ведомств. Численность и персональный состав коллегии утверждаются Правительством Республики Саха (Якутия).
6.6. Для научного анализа проблем в области строительства, архитектуры и градостроительства, лесопромышленного комплекса в Министерстве образуются градостроительный, научно-технический и экономический советы. Персональный состав указанных советов и положения о них утверждаются министром.