Основными задачами Министерства являются:
2.1. Совершенствование бюджетной системы Республики Саха (Якутия), бюджетного федерализма.
2.2. Участие в разработке и проведение единой финансовой, бюджетной, налоговой, инвестиционной и валютной политики в Республике Саха (Якутия).
2.3. Разработка и реализация единой политики управления государственным долгом.
2.4. Концентрация государственных финансовых ресурсов на приоритетных направлениях социально-экономического развития Республики Саха (Якутия).
2.5. Разработка прогноза и исполнение в установленном порядке консолидированного бюджета Республики Саха (Якутия), составление отчета об исполнении республиканского и консолидированного бюджетов Республики Саха (Якутия), разработка единой методологии составления бюджетов всех уровней.
2.6. Разработка программ государственных заимствований и их реализация в установленном порядке от имени Республики Саха (Якутия).
2.7. Организация и осуществление в пределах своей компетенции государственного финансового контроля за исполнением Государственного бюджета Республики Саха (Якутия).
2.8. Обеспечение методологического руководства бухгалтерским учетом и отчетностью (кроме бухгалтерского учета и отчетности в Национальном банке Республики Саха (Якутия) и кредитных организациях).