2.1. Подготовка и принятие решений по реализации указов и распоряжений Президента Республики Саха (Якутия), постановлений и распоряжений Правительства Республики Саха (Якутия), приказов Минздрава РФ по улучшению медицинской помощи населению республики, Концепции развития здравоохранения и медицинской науки в Республике Саха (Якутия).
2.2. Выработка стратегии Министерства по сохранению и укреплению здоровья населения, снижению младенческой и материнской смертности, улучшению санитарно-эпидемиологического состояния, подбору, расстановке, подготовке и переподготовке медицинских кадров.