Для решения возложенных задач Министерство осуществляет следующие функции:
3.1. В области комплексных проблем здравоохранения:
3.1.1. Обеспечивает единство и целостность системы здравоохранения путем реализации государственной политики в области здравоохранения.
3.1.2. Подготавливает ежегодный доклад Правительству Республики Саха (Якутия) о реализации государственной политики в области охраны здоровья граждан, состоянии здоровья населения в республике.
3.1.3. Разрабатывает совместно с Территориальным фондом обязательного медицинского страхования, республиканскими органами исполнительной власти, при участии научно-исследовательских медицинских учреждений и общественных объединений, проекты республиканских целевых программ в области здравоохранения, в том числе по вопросам обеспечения, выполняет функции государственного заказчика указанных республиканских целевых программ.
3.1.4. Осуществляет контроль за ходом выполнения федеральных целевых программ в области здравоохранения.
3.1.5. Разрабатывает проекты законодательных и иных нормативных правовых актов в области здравоохранения.
3.1.6. Проводит в установленном порядке экспертизу проектов республиканских целевых и иных программ, затрагивающих вопросы охраны здоровья, входящие в компетенцию Министерства.
3.1.7. Содействует созданию, лицензированию и организации деятельности, а также осуществляет контроль за негосударственными учреждениями и организациями здравоохранения.
3.1.8. Определяет потребности в лекарственных, диагностических и дезинфекционных средствах, иммунобиологических препаратах, изделиях медицинского назначения, медицинской технике и участвует в определении объемов поставок этой продукции для нужд медицинских учреждений республики.
3.1.9. Участвует в разработке балансов спроса и предложения лекарственных, диагностических и дезинфекционных средств, иммунобиологических препаратов, изделий медицинского назначения и медицинской техники.
3.1.10. Совместно с заинтересованными республиканскими органами исполнительной власти осуществляет контроль за оборотом и порядком использования наркотических и психотропных средств в учреждениях здравоохранения.
3.1.11. Утверждает единую номенклатуру и типовые категории учреждений здравоохранения.
3.1.12. Осуществляет в установленном порядке контроль за финансово-хозяйственной деятельностью подведомственных Министерству учреждений, предприятий и организаций.
3.1.13. Рассматривает предложения, заявления и жалобы граждан и принимает по ним необходимые меры, организует прием граждан по вопросам, отнесенным к его компетенции.
3.2. В области профилактики заболеваний, медицинской помощи, инвалидности, медицинской экспертизы:
3.2.1. Обеспечивает совершенствование профилактической, лечебно-диагностической и лечебно-оздоровительной работы.
3.2.2. Развивает санаторно-курортные учреждения системы Министерства здравоохранения Республики Саха (Якутия), осуществляет руководство и контроль за их деятельностью.
3.2.3. Организует диспансеризацию и медицинскую реабилитацию лиц, подвергшихся техногенному и радиационному воздействию.
3.2.4. Организует в учреждениях здравоохранения профилактическую работу, диспансеризацию и медицинскую реабилитацию больных, страдающих хроническими заболеваниями, в том числе алкоголизмом, наркоманией, токсикоманией и другими социально значимыми заболеваниями.
3.2.5. В пределах своей компетенции осуществляет методическое руководство медицинской реабилитацией инвалидов.
3.2.6. Определяет целесообразность и организует лечение граждан Республики Саха (Якутия) в медицинских клиниках Российской Федерации и за рубежом.
3.2.7. Разрабатывает предложения по оказанию медицинской помощи нуждающимся в социальной защите группам населения (детям, пенсионерам, лицам, больным определенными заболеваниями, и др.).
3.3. В области охраны семьи, материнства, отцовства и детства:
3.3.1. Разрабатывает мероприятия, обеспечивающие охрану здоровья матери, отца, ребенка и членов семьи, осуществляет контроль за их выполнением.
3.3.2. Участвует в решении вопросов медико-социальной помощи семье, матери, отцу и ребенку.
3.3.3. Разрабатывает предложения, направленные на улучшение питания детей, беременных женщин и кормящих матерей.
3.4. В области медицинской статистики и информатизации: