Министерство имеет право:
4.1. Осуществлять по вопросам, отнесенным к его компетенции, инспектирование и проверку образовательных учреждений и органов управления образованием на территории Республики Саха (Якутия), а также делегировать эти права другим государственным органам управления образованием.
4.2. Образовывать в необходимых случаях комиссии и экспертные советы, а также временные научные (творческие) коллективы и рабочие группы и финансировать их деятельность.
4.3. Приостанавливать в установленном порядке деятельность подведомственных образовательных учреждений, осуществляемую с нарушениями требований законодательства Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) в области образования и уставов образовательных учреждений.
4.4. Определять структуру и организовывать республиканскую систему подготовки и переподготовки педагогических и управленческих кадров для системы образования.
4.5. Отстаивать и защищать интересы и права учреждений образования, педагогических работников в соответствии с действующим законодательством.
4.6. Запрашивать и получать в установленном порядке от республиканских и улусных органов исполнительной власти, органов местного самоуправления, учреждений и организаций (независимо от их организационно-правовой формы и ведомственной принадлежности) сведения, материалы и документы, необходимые для осуществления возложенных на Министерство задач и функций.
4.7. Участвовать в порядке, установленном законодательством Республики Саха (Якутия) и Российской Федерации, в учреждении организаций для поддержки развития образования и научно-технической деятельности, в том числе международных.
4.8. Издавать в пределах своей компетенции нормативно-правовые акты в виде приказов, распоряжений, правил, инструкций и положений.