4.1. Контроль и охрану за состоянием озера осуществляет специально уполномоченный орган Министерства охраны природы Республики Саха (Якутия), также Администрация Нюрбинского улуса.
Поддержание в надлежащем состоянии водоохранной зоны и вод озера "Дженкюде", а также соблюдения режима использования их территорий возлагается на руководителей объединений, предприятий, организаций и учреждений, независимо от их ведомственной подчиненности и на граждан, в пользовании которых находятся земельные участки.
4.2. Охрана особо охраняемого уникального озера "Дженкюде" осуществляется силами администраций Аканинского, Кангаласского и Тюмюкского наслегов или отдельной инспекции по охране особо охраняемых природных территорий, наделенной соответствующими полномочиями.