4.1. Службу возглавляет руководитель Службы, назначаемый на должность и освобождаемый от должности правовым актом Губернатора Ямало-Ненецкого автономного округа.
4.2. Руководитель несёт персональную ответственность за выполнение возложенных на Службу полномочий и реализацию государственной политики в установленной сфере деятельности.
4.3. Руководитель Службы имеет первого заместителя руководителя Службы, который осуществляет свою деятельность на освобождённой основе и исполняет обязанности руководителя при его временном отсутствии в соответствии с приказом руководителя Службы.
4.4. Первый заместитель руководителя Службы назначается на должность и освобождается от должности правовым актом Губернатора автономного округа по представлению руководителя Службы, согласованному с заместителем Губернатора автономного округа, курирующим соответствующую сферу деятельности.
4.5. Правовые акты и документы (приказы о заключении служебных контрактов на определённый срок, служебные контракты на определённый срок, командировочные удостоверения, иные документы) по вопросам осуществления трудовых отношений с руководителем Службы и первым заместителем руководителя Службы от имени представителя нанимателя подписывает заместитель Губернатора, руководитель аппарата Губернатора автономного округа.
4.6. Структурными подразделениями Службы являются управление, отделы, секторы.
4.7. Руководитель Службы:
4.7.1. по вопросам, входящим в компетенцию Службы, представляет без доверенности интересы Службы в федеральных органах государственной власти, органах государственной власти субъектов Российской Федерации, муниципальных образованиях в автономном округе, судебных органах, организациях;
4.7.2. даёт заключения и предложения по проектам правовых актов автономного округа в установленной сфере деятельности Службы;
4.7.3. вносит в установленном порядке на рассмотрение Губернатора и Администрации автономного округа проекты правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию Службы;
4.7.4. утверждает положения о структурных подразделениях Службы, должностные регламенты государственных гражданских служащих Службы;
4.7.5. в установленном порядке назначает на должность и освобождает от должности государственных гражданских служащих Службы и работников, замещающих должности, не отнесённые к должностям государственной гражданской службы автономного округа, и заключает с ними служебные контракты (трудовые договоры);
4.7.6. решает в соответствии с законодательством Российской Федерации и законодательством автономного округа о государственной гражданской службе вопросы, связанные с прохождением государственной гражданской службы автономного округа;
4.7.7. представляет в установленном порядке государственных гражданских служащих Службы и других лиц, осуществляющих деятельность в установленной сфере, к присвоению почётных званий и награждению государственными наградами Российской Федерации, а также присвоению почётных званий автономного округа;
4.7.8. в установленном порядке распоряжается средствами, выделенными Службе по смете доходов и расходов, утверждённой в установленном порядке;
4.7.9. выдаёт доверенности, заключает договоры и соглашения в пределах своих полномочий;
4.7.10. издаёт приказы по вопросам, относящимся к компетенции Службы;
4.7.11. осуществляет иные полномочия в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации и автономного округа, настоящим Положением.