В соответствии с пунктом 3 части 1 статьи 6 Основ законодательства об охране здоровья граждан разработка и исполнение региональных программ относятся к компетенции органов государственной власти субъекта Российской Федерации, финансирование мероприятий Программы в 2011 - 2013 годы будет осуществляться департаментом здравоохранения непосредственно, без распределения субсидий по муниципальным образованиям в автономном округе.
Департамент здравоохранения осуществляет полномочия по обеспечению проведения единой государственной политики в сфере здравоохранения и выполняет функции по организации оказания специализированной медицинской помощи. Статьёй 37.1 Основ законодательства об охране здоровья граждан определено, что специализированная медицинская помощь оказывается гражданам при заболеваниях, требующих специальных методов диагностики, лечения и использования сложных медицинских технологий.
Реализация мероприятий централизованно через департамент здравоохранения позволит обеспечить экономию бюджетных средств при проведении закупок для государственных нужд в рамках Федерального закона от 21 июля 2005 года N 94-ФЗ "О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд", определив масштабность производимой закупки, без деления на мелкие суммы по муниципальным образованиям в автономном округе, а также позволит обеспечить достаточный контроль за реализацией программных мероприятий.