Современная стратегия охраны природы заключается в сохранении экологического равновесия на территории региона на основе создания экологического каркаса, ключевыми звеньями которого являются особо охраняемые природные территории. ООПТ преимущественно выполняют функции резерватов по сохранению численности, охраны видового разнообразия животных, в том числе редких и находящихся под угрозой исчезновения (приложение N 8 к настоящей Схеме).
Существующая сеть ООПТ носит островной характер, природоохранные объекты отрезаны друг от друга и не соединены зелеными коридорами, необходимыми для формирования экологического каркаса. Часть ООПТ находится в районах сильной и умеренной нарушенности экосистем и заняты лицензионными участками для целей недропользования, что не позволяет им в полной мере выполнять средоохранные функции. Развитие инфраструктуры нефтегазового комплекса автономного округа, реализация проекта "Урал Промышленный - Урал Полярный" требуют совершенствования системы охраны и пространственной структуры особо охраняемых природных территорий автономного округа.
На 1 января 2008 года сеть особо охраняемых природных территорий автономного округа включает в себя расположенные в различных ландшафтных зонах:
- два государственных природных заповедника (Верхнее-Тазовский в Красноселькупском районе, Гыданский в Тазовском районе);
- три государственных биологических заказника федерального значения (Куноватский в Шурышкарском районе, Надымский в Надымском районе и Нижнее-Обский в Ямальском районе);
- восемь государственных биологических заказников окружного значения (Горнохадатинский, Собты-Еганский, Полуйский, Верхне-Полуйский, Полярно-Уральский в Приуральском районе, Мессо-Яхинский в Тазовском районе, Ямальский (участки Северо-Ямальский и Южно-Ямальский) в Ямальском районе, Пякольский в Красноселькупском районе);
- один геологический памятник природы окружного значения (Харбейский в Приуральском районе).
Общая площадь природно-заповедного фонда в автономном округе в настоящее время составляет 5292871 га (6,88% от площади округа), из них площадь государственных природных заповедников 1509482 га (1,96%); площадь заказников федерального значения - 912000 га (1,19%), площадь ООПТ регионального значения - 2871389 га (3,73%).
Анализ существующей сети ООПТ показал недостаточную обеспеченность округа особо охраняемыми природными территориями. Кроме того, более 30% их площади находится в районах сильной и умеренной нарушенности экосистем и заняты лицензионными участками для целей недропользования, что не позволяет им в полной мере выполнять средоохранные функции.
В связи с дальнейшим усилением хозяйственной деятельности необходимо расширение существующей сети особо охраняемых природных территорий и регулирование отношений по образованию и правовым режимам ООПТ. Расширение площади ООПТ до 10 - 15% от общей площади автономного округа, считается оптимальным для поддержания экологического равновесия за счёт ограничения территориального развития промышленных предприятий, прежде всего нефтегазодобывающих. Необходимость образования новых ООПТ, прежде всего природных парков, обусловлена высокой уязвимостью арктических и субарктических экосистем и их важной ролью в обеспечении устойчивого развития территории.
Для законодательно-правового закрепления выделенных территорий, как перспективных ООПТ - ядер экологического каркаса, требуется утверждение Администрацией автономного округа резервного фонда особо охраняемых природных территорий, где должны быть введены особые режимы природопользования.