К полномочиям органов государственной власти Республики Алтай в области местного самоуправления относятся:
1) принятие и изменение законов Республики Алтай о местном самоуправлении, контроль за их соблюдением;
2) обеспечение соответствия законов Республики Алтай о местном самоуправлении Конституции Российской Федерации, федеральным конституционным законам и федеральным законам, Конституции Республики Алтай;
3) регулирование порядка передачи и передача объектов собственности Республики Алтай в муниципальную собственность;
4) регулирование взаимоотношений между бюджетом Республики Алтай и местными бюджетами;
5) обеспечение сбалансированности минимальных местных бюджетов на основе нормативов минимальной бюджетной обеспеченности;
6) наделение органов местного самоуправления законом отдельными государственными полномочиями органов государственной власти Республики Алтай, передача материальных и финансовых средств, необходимых для осуществления переданных полномочий, контроль за их реализацией;
7) принятие региональных программ развития местного самоуправления;
8) защита прав граждан на осуществление местного самоуправления;
9) обеспечение гарантий финансовой самостоятельности местного самоуправления;
10) обеспечение государственных минимальных социальных стандартов;
11) установление и изменение порядка образования, объединения, преобразования или упразднения муниципальных образований, установление и изменение их границ и наименований;
12) компенсация местному самоуправлению дополнительных расходов, возникших в результате решений, принятых органами государственной власти республики;
13) регулирование законами Республики Алтай в соответствии с Федеральным законом "Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации" особенностей организации местного самоуправления с учетом исторических и иных местных традиций;
14) принятие законов о муниципальной службе;
15) принятие законов об административных правонарушениях по вопросам, связанным с осуществлением местного самоуправления;
16) установление порядка регистрации уставов муниципальных образований.