Министерство образования, науки и молодёжной политики Республики Алтай осуществляет функции государственного заказчика, определенные в постановлении Правительства Республики Алтай от 22 января 2009 года N 9 "О порядке разработки, утверждения и реализации долгосрочных республиканских целевых программ".
Организационное сопровождение Программы будет осуществлять Республиканская правительственная комиссия по нравственному и военно-патриотическому воспитанию, допризывной подготовки молодежи Республики Алтай, состав которой утверждается Правительством Республ Республики Алтай.