Базовый принцип построения механизма реализации мероприятий Программы - совместная работа всех государственных заказчиков по формированию здорового образа жизни населения Республики Алтай.
Государственным заказчиком - координатором Программы выступает Министерство здравоохранения Республики Алтай.
Организация полной, точной и своевременной реализации отдельных мероприятий Программы возлагается на государственных участников Программы - Министерство образования, науки и молодежной политики Республики Алтай, Министерство труда и социального развития Республики Алтай, Министерство культуры Республики Алтай, Комитет по физической культуре и спорту Республики Алтай
Контроль за реализацией Программы, своевременностью и полнотой выполнения намеченных мероприятий осуществляет Министерство экономического развития и инвестиций Республики Алтай.