На начало 2012 года функционируют 3 республиканских учреждения начального профессионального образования с контингентом обучающихся 1535 человек, 5 республиканских учреждений среднего профессионального образования с контингентом обучающихся 3427 человек, республиканские учреждения высшего профессионального образования отсутствуют.
На сегодняшний день экономика региона испытывает дефицит специалистов и рабочих кадров в сфере туризма, в строительной отрасли, в сфере торговли, транспортного хозяйства, ремонтных и обслуживающих сервисов, пищевой промышленности. Ежегодно в образовательные учреждения начального и среднего профессионального образования поступает 50% выпускников 9-х и 11-х классов.
В Республике Алтай функционирует одно учреждение дополнительного профессионального образования - бюджетное образовательное учреждение Республики Алтай "Институт повышения квалификации и профессиональной переподготовки работников образования Республики Алтай" с количеством слушателей курсов - 1000 человек в год.
Перед системой профессионального образования остро стоят проблемы:
разрыв между профессионально-квалификационной структурой предлагаемой рабочей силы на рынке труда и требованием работодателей, что усиливает имеющийся дефицит кадров по требуемым профессиям и специальностям;
профессиональная ориентация выпускников общеобразовательных учреждений, без учета обеспечения экономики необходимыми кадровыми ресурсами.