Оценка эффективности реализации Программы осуществляется как по косвенным показателям медицинской и криминальной статистики, так и расчетным путем.
По результатам деятельности каждый год Межведомственная комиссия представляет в Правительство Республики Алтай анализ ситуации по злоупотреблению наркотическими средствами и их незаконному обороту в Республике Алтай. Данный анализ, по решению Межведомственной комиссии, может быть опубликован в республиканских газетах.
Реализация Программы, при условии финансовой поддержки органов власти Республики Алтай, позволит значительно сократить рост наркомании, как социального явления (до уровня минимальной опасности), приостановить распространение наркотиков в республике.