Государственным заказчиком Программы является Министерство финансов Республики Алтай. Механизм финансирования корректируется в зависимости от достижения (недостижения) плановых обозначаемых целевых показателей.
Предполагаемыми участниками мероприятий Программы являются бюджетные организации, администрации муниципальных образований Республики.
Государственный заказчик осуществляет меры по полному качественному выполнению мероприятий Программы, подготовке информации, докладов по результатам выполнения мероприятий Программы и организационно-техническое обеспечение работы Программы. А также Министерство финансов Республики Алтай формирует и представляет в Министерство экономического развития и инвестиций Республики Алтай отчет о выполнении программы.
Контроль за целевым расходованием средств, направленных на реализацию программы осуществляется Министерством финансов Республики Алтай и Министерством экономического развития и инвестиций Республики Алтай.