Общее руководство реализацией Программы осуществляет Министерство образования и науки Республики Северная Осетия-Алания, являющееся координатором Программы. Координатор Программы готовит предложения по оптимизации порядка её выполнения, включению, исключению и корректировке содержания отдельных мероприятий, уточняет целевые показатели, осуществляет текущий контроль за её реализацией.
Исполнители программных мероприятий представляют в Министерство образования и науки Республики Северная Осетия-Алания информацию о выполнении мероприятий и использовании выделенных средств.
Ежегодно Министерство образования и науки Республики Северная Осетия-Алания представляет в Правительство Республики Северная Осетия-Алания систематизированную, обобщенную информацию о ходе реализации Программы.